dc.contributor.advisor | Akyol, Aytekin | |
dc.contributor.author | Uzun, Sarp | |
dc.date.accessioned | 2021-04-27T10:42:17Z | |
dc.date.issued | 2021 | |
dc.date.submitted | 2021-04-09 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/23665 | |
dc.description.abstract | Uzun, S, Investigation of The Role of β-catenin N-terminal Domain Alterations in
Neoplastic Processes, Hacettepe University Graduate School of Health Sciences
Tumor Biology and Immunology Program Doctor of Philosophy Thesis, Ankara,
2021. β-catenin is a multifunctional protein and located at the center of Wnt
pathway. Intracellular localization and level of β-catenin are strictly controlled by
special amino acid residues located at its N-terminal domain. These amino acid
residues are encoded by the third exon (exon 3) of CTNNB1 (β-catenin encoding gene)
and the mutations altering this region lead to neoplastic transformation by changing
the amino acid sequence of the N-terminal domain. Our research group has recently
defined an immunohistochemistry-based approach that can detect CTNNB1 exon 3
mutations. The primary purpose of this study is to evaluate the CTNNB1 exon 3
alterations in neoplastic diseases of unknown pathogenesis by using this
immunohistochemistry-based approach. For this purpose, β-catenin N-terminal
domain alterations were evaluated with this method in the cases of sclerosing
angiomatoid nodular transformation (SANT) of the spleen, a rare vascular lesion of
the spleen. As a result of immunohistochemical staining, findings suggesting the
presence of exon 3 mutations were obtained. These findings were confirmed with
polymerase chain reaction and Sanger sequencing. The secondary purpose of this
study is to evaluate the post-translational modifications of the β-catenin N-terminal
domain by using the immunohistochemical staining method that we have described.
For this purpose, the intracellular localization of β-catenin phosphorylated at the
amino acids S33, S37 and T41 (phospho-S33/S37/T41-β-catenin) was investigated
using immunohistochemical and immunofluorescent staining methods, and it was
shown that this protein could accumulate in the nucleus of the colon cancer cells. By
evaluating protein lysates of colorectal cancer patients with Western Blot method, it
was also suggested that low molecular weight β-catenin forms might be formed after
proteolytic cleavage of N-terminal and C-terminal regions of β-catenin. | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Kanser Enstitüsü | tr_TR |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
dc.subject | β-catenin | tr_TR |
dc.subject | CTNNB1 | tr_TR |
dc.subject | ekzon 3 | tr_TR |
dc.subject | fosfo-β-catenin | tr_TR |
dc.subject | WNT | tr_TR |
dc.title | Β-Catenın N-Terminal Bölge Değişikliklerinin Neoplastik Süreçlerdeki Rolünün Araştırılması | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | tr_TR |
dc.description.ozet | Uzun, S, β-catenin N-Terminal Bölge Değişikliklerinin Neoplastik Süreçlerdeki
Rolünün Araştırılması, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tümör
Biyolojisi ve İmmünolojisi Programı Doktora Tezi, Ankara, 2021. β-catenin, Wnt
sinyal yolağının merkezinde yer alan çok fonksiyonlu bir proteindir. β-catenin’in hücre
içi yerleşimi ve seviyesi, N-terminal bölgesinde yer alan özel bir amino asit dizisi
sayesinde sıkı bir şekilde kontrol edilmektedir. Bu amino asit dizisi CTNNB1’in (β-
catenin’i kodlayan gen) üçüncü ekzonu (ekzon 3) tarafından kodlanmaktadır ve bu
ekzonda görülen mutasyonlar N-terminal bölgede yer alan amino asit dizisini
değiştirerek neoplastik transformasyona neden olmaktadır. Araştırma grubumuz
tarafından CTNNB1 ekzon 3 mutasyonlarının tespit edilmesini sağlayan
immünohistokimyasal boyama temelli bir yöntem tanımlanmıştır. Bu tez çalışmasının
birincil amacı, tanımladığımız yöntemi kullanarak patogenezi bilinmeyen neoplastik
hastalıklarda CTNNB1 ekzon 3 mutasyonlarının araştırılmasıdır. Bu kapsamda, dalağın
nadir görülen vasküler lezyonlarından biri olan sklerozan anjiomatoid nodüler
transformasyon (SANT) olgularında tanımladığımız yöntemle N-terminal bölge
değişiklikleri incelenmektedir. İmmünohistokimyasal boyama sonucunda ekzon 3
mutasyonu varlığını düşündüren bulgular elde edilmektedir. Bu bulgular polimeraz
zincir reaksiyonu ve Sanger sekanslama ile doğrulanmaktadır. Tez çalışmasının ikincil
amacı ise tanımladığımız immünohistokimyasal boyama yöntemini kullanarak β-
catenin’in N-terminal bölgesini etkileyebilecek post-translasyonel modifikasyonların
araştırılmasıdır. Bu amaç doğrultusunda immünohistokimyasal ve immünofloresan
boyama yöntemleri kullanılarak S33, S37 ve T41 amino asitlerinden fosforile olan β-
catenin’in (fosfo-S33/S37/T41-β-catenin) hücre içi yerleşimi incelenmektedir ve bu
proteinin kolon kanseri hücrelerinin çekirdeğinde birikebileceği gösterilmektedir. Ek
olarak kolorektal kanser protein lizatlarında Western Blot yöntemi ile N-terminal ve
C-terminal bölgesinden proteolitik olarak kesilmiş, düşük moleküler ağırlığı sahip β-
catenin formlarının bulunabileceği ileri sürülmektedir. | tr_TR |
dc.contributor.department | Temel Onkoloji | tr_TR |
dc.embargo.terms | 6 ay | tr_TR |
dc.embargo.lift | 2021-10-30T10:42:17Z | |
dc.funding | Yok | tr_TR |