| dc.contributor.advisor | Sevin Düz, Fatma | |
| dc.contributor.author | Kınık, Özlem | |
| dc.date.accessioned | 2018-12-26T10:23:46Z | |
| dc.date.issued | 2018 | |
| dc.date.submitted | 2018-09-07 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/5485 | |
| dc.description.abstract | Nowadays, the stability of metal-mediated DNA base pairs and their ability to control the incorporation or removal of metals into pairs of DNA bases is an important contribution to the creation of metallo-DNA sensors and DNA computer keys. In this thesis, considering zeolite Y cluster models with two different aluminum positions structures, energetics and spectroscopic properties of HgY and AgY zeolites with Hg2+ and Ag+ metals were calculated using the DFT method at the level of M06L-LANL2DZ.
Hg2+ and Ag+ model binary base complex zeolites are preffered Adenine to Timine. As the number of bases coordinated to metal ions increases, the HOMO-LUMO band gap decreases about 1 eV. A-T coordinations of KM2 which contains both metal ions have the largest HOMO-LUMO band widths. KM2-Ag-T-T complex has the lowest degree of hardness. Computational UV-Vis adsorption results show that; for both metal ions, increasing the number of coordination of bases to model zeolite clusters causes absorptions at longer wave lengths. (eg. KM1-Hg-A-T; 248 nm, KM1-Ag-A-T; 574 nm)
Keywords: Zeolite Y, DNA base pairs, DFT, Hg2+, Ag+ | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.publisher | Fen Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
| dc.subject | Research Subject Categories::NATURAL SCIENCES::Chemistry::Organic chemistry | tr_TR |
| dc.subject | Geolit Y | |
| dc.subject | Dna Baz Çiftleri | |
| dc.subject | Dft | |
| dc.subject | Ag+ | |
| dc.subject | Hg2+ | |
| dc.title | HgY ve AgY Zeolitlerine Adenin Ve Timin Bazlarının Adsorpsiyonunun Teorik Çalışması | tr_TR |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | tr_TR |
| dc.description.ozet | Günümüzde metal-aracılı DNA baz çiftlerinin kararlılığı ve DNA baz çiftlerine metallerin katılmasını ya da uzaklaştırılmasının kontrol edilebilmesi, metallo-DNA sensörlerin ve DNA bilgisayar anahtarların oluşturulmasında önemli katkı sağlayabilecek çalışmalardır. Bu tezde, iki farklı alüminyum pozisyonlarına sahip zeolit Y küme modelleri ele alınarak, Hg2+ ve Ag+ metalleri ile HgY ve AgY zeolitlerinin, yapıları, enerjetikleri ve spektroskopik özellikleri B3LYP/LANL2DZ seviyesinde, DFT metodu kullanarak hesaplanmıştır.
Hg2+ ve Ag+ li model zeolit ikili baz komplekslerinde, Adenin Timin’e göre tercihlidir. Metal iyonlarına koordine olan baz sayısı arttıkça HOMO-LUMO bant aralığı yaklaşık 1 eV azalmaktadır. HOMO-LUMO bant genişliği en fazla olanlar, her iki metal iyonlarını içeren KM2’ ye bağlı A-T kompleksleridir. En düşük sertlik derecesine sahip kompleks KM2-Ag-T-T dir. Hesapsal UV-Vis absorbsiyon sonuçları göstermiştir ki; her iki metal iyonu için, model zeolit kümelerine bazların koordinasyon sayısının artmasi ile daha uzun dalga boylarında absorbsiyon yapmaktadır (KM1-Hg-A-T; 248 nm, KM1-Ag-A-T; 574 nm). | tr_TR |
| dc.contributor.department | Kimya | tr_TR |
| dc.contributor.authorID | 10215338 | tr_TR |
| dc.embargo.terms | 2 yil | tr_TR |
| dc.embargo.lift | 2020-12-27T10:23:47Z | |
