Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisorHASÇELİK, Ayşe Gülşen
dc.contributor.authorALTAY AKIŞOĞLU, Havva Özlem
dc.date.accessioned2019-01-24T13:55:50Z
dc.date.issued2019
dc.date.submitted2018-12-12
dc.identifier.citationAKIŞOĞLU O, ENGİN D , SARIÇAM S , MÜŞTAK HK ,ŞENER B , HASÇELİK Gtr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11655/5725
dc.description.abstractThe aim of this study was to identify Burkholderia spp. strains isolated from CF and non-CF patients with routine microbiological methods and multilocus sequence analysis (MLSA), to determine the antibiotic susceptibility and synergies, and to evaluate biofilm formation of these isolates. A total of 38 isolates from 26 patients identified as B. cenocepacia (n=16), B. contaminans (n=11), B. gladioli (n=4), B. dolosa (n=4), B. multivorans (n=2) and B. seminalis (n=1). Correct species-level identification of MALDI-TOF MS was 66%. Biofilm formation in these species was determined as 53% (n=20) and there was no statistical difference in biofilm production among Burkholderia species. Overall rates of susceptibility to ceftazidime, meropenem, TMP-SXT, and levofloxacin of the isolates was 66%, 34%, 50%and 60%, respectively. In antibiotic resistance against Burkholderia spp., isolates obtained from CF patients were more susceptible to ceftazidime, but no significant difference was found for other antibiotics. Synergy has shown between meropenem and TMP-SXT at two isolates. Antagonism has detected at 15 isolates, 12 of them were between meropenem and ceftazidime, three of them were between ceftazidime and TMP-SXT. This study identifies the distinctness of sequence types between Burkholderia spp. isolated from CF and non-CF patients provide a better understanding of the importance of biofilm formation for the infections with these bacteria and emphasize the management of therapy should be driven by the antibiotic test results.en
dc.description.sponsorshipÇalışma Hacettepe Üniversitesi BAP Koordinasyon Birimi tarafından desteklenmiştir. Proje Kodu: THD-2016-10613 Öğrenci doktora eğitimi sırasında TÜBİTAK Bilim İnsanı Destek Programları Başkanlığı 2214-A kapsamında desteklenmiştir. Proje Kodu: 1059B141601066tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER ONAY SAYFASI iii YAYIMLAMA VE FİKRİ MÜLKİYET HAKLARI BEYANI iv ETİK BEYAN v TEŞEKKÜR vi ÖZET vii ABSTRACT viii İÇİNDEKİLER ix SİMGE VE KISALTMALAR xi ŞEKİLLER xii TABLOLAR xiii 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1 Mikrobiyolojik Özellikler 3 2.2 Taksonomi 3 2.3 Epidemiyoloji 7 2.3.1 Tiplendirme 9 2.4 Patogenez 11 2.5 Klinik (KF ve Burkholderia) 15 2.6 Tanı 16 2.7 Antibiyotik Duyarlılık 21 2.7.1 Burkholderia Türlerinde Önerilen Antibiyotik Duyarlılık Yöntemi ve Kullanılan Antibiyotikler 23 2.7.2 Burkholderia Türlerinde Sinerji Testleri 24 2.7.3 Burkholderia Türlerinde Direnç Mekanizmaları 25 2.8 Tedavi 26 3. GEREÇ VE YÖNTEM 28 3.1 Bakteri İzolatları 28 3.2 Bakteri İzolatlarının Rutin Yöntemlerle Tanımlanması 28 3.3 Bakteri İzolatlarının Multilokus Sekans Analizi ile Tanımlanması 29 3.3.1 DNA İzolasyonu 29 3.3.2 Multilokus Sekans Tiplendirmesi (MLST) 30 3.4 Mikroplak Yöntemi ile Biyofilm Üretiminin Değerlendirilmesi 34 3.5 Sıvı Mikrodilüsyon Yöntemi ile Antibiyotik Duyarlılıklarının Değerlendirilmesi 35 3.6 Sinerji Testi ile Antibiyotik Kombinasyonlarının Duyarlılıklarının Değerlendirilmesi 38 3.7. İstatistiksel Analiz 40 4. BULGULAR 41 5. TARTIŞMA 53 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 66 7. KAYNAKLAR 68 8. EKLER EK-1 Turnitin Orjinallik Raporu Dijital Makbuz EK-2 Turnitin Orjinallik Raporu Ekran Görüntüsü 9. ÖZGEÇMİŞtr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherSağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectBurkholderia spp.tr_TR
dc.subjectMALDI-TOF MS
dc.subjectmultilokus sekans analizi
dc.subjectbiyofilm
dc.subjectantibiyotik duyarlılık
dc.titleBurkholderia Türlerinin Moleküler Yöntemlerle Tiplendirilmesi, Türler Arasında Biyofilm Oluşumu ve Antibiyotik Direnç Farklılığının Belirlenmesi.tr_TR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisen
dc.description.ozetBu çalışmada, kistik fibrozisli (KF) ve KF olmayan hastalardan izole edilen Burkholderia türlerinin rutin mikrobiyolojik yöntemler ve multilokus sekans analizi (MLSA) ile tanımlanması, biyofilm oluşumunun değerlendirilmesi, antibiyotik duyarlılıkları ve sinerjilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yirmialtı farklı hastaya ait 38 izolat B. cenocepacia (n:16), B. contaminans (n:11), B. gladioli (n: 4), B. dolosa (n:4), B. multivorans (n:2) ve B. seminalis (n:1) olarak belirlenmiştir. Tür düzeyinde MALDI-TOF MS ile doğru tanımlama %66 olarak bulunmuştur. Çalışılan izolatlarda biyofilm oluşumu %53 (n = 20) olarak belirlenmiş ve türler arasında anlamlı bir fark bulunmamıştır. İzolatların seftazidim, meropenem, TMP-SXT ve levofloksasine karşı duyarlılıkları sırasıyla %66, %34, %50 ve %60 olarak belirlenmiştir. Burkholderia türlerine karşı antibiyotik direncinde, KF hastalarından elde edilen izolatlar seftazidime daha duyarlı bulunmuş, diğer antibiyotikler için anlamlı fark saptanmamıştır. İki izolatta meropenem ve TMP-SXT arasında sinerji gözlenmiştir. Onbeş izolatta antagonizma tespit edilmiş, bunun 12’si meropenem ile seftazidim, 3’ü seftazidim ile TMP-SXT arasında bulunmuştur. Bu çalışma KF ve KF olmayan hastalarda izole edilen Burkholderia spp. sekans sonuçlarının farkını, biyofilm oluşumunun bu bakteri ile oluşan enfeksiyonlarda önemli olduğunu ve tedavinin in vitro antibiyotik duyarlılık test sonuçlarına göre değerlendirilmesi gerektiğini göstermiştir.tr_TR
dc.contributor.departmentMikrobiyolojitr_TR
dc.embargo.termsAcik erisimtr_TR
dc.embargo.lift2019-01-24T13:55:50Z


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster