dc.contributor.advisor | EKMEKÇİ, YASEMİN | |
dc.contributor.author | BALKAN NALÇAİYİ, AYŞE SUNA | |
dc.date.accessioned | 2018-02-12T05:59:45Z | |
dc.date.available | 2018-02-12T05:59:45Z | |
dc.date.issued | 2017 | |
dc.date.submitted | 2018-01-19 | |
dc.identifier.citation | BALKAN NALÇAİYİ, A.S, AYÇİÇEĞİ (Helianthus annuus L.) GENOTİPLERİNDE KURAKLIĞA DAYANIKLILIĞIN FİZYOLOJİK,
BİYOKİMYASAL VE MOLEKÜLER DÜZEYDE İNCELENMESİ, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, ANKARA, 2018 | tr_TR |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/4270 | |
dc.description.abstract | In this study, it was aimed to investigate the responses of registered sunflower
cultivars grown in our country with their wild hybrids and wild Helianthus agrophyllus,
identified to be drought tolerant, at morphological, physiological, biochemical and
molecular (proteomic) levels during drought and recovery. In the first stage,
sunflower cultivars were exposed to two different drought treatments (moderate -7
days / severe-9 days) and then recovery (irrigation-5 days). In this stage,
photosynthetic activities (chlorophyll a fluorescence measurements), membrane
damage (ion leakage), photosynthetic pigment and water contents of the cultivars
were measured. Drought-recovery factor indexes and damage-recovery potential
indexes were calculated from photosynthetic performance indexes, and
physiological and biochemical measurements, respectively. These calculations
allowed classification of the genotypes to three tolerance levels: drought-tolerant
(Şems, Sirena, Tarsan-1018), moderately tolerant (Duna, Hornet, Tunca) and
sensitive (Bosfora, Coral, Kaan). In the second stage of the study, the drought
responses of selected cultivars with the wild hybrids of the sunflower (Helianthus
annuus x Helianthus agrophyllus and Helianthus annuus x Helianthus deserticola)
iv
subjected to drought stress for 9 days and then 5-days recovery were proved by
using the morphological, photosynthetic, physiological and biochemical parameters.
Genotypes were characterized according to their drought tolerances by calculating
damage indexes and recovery potentials from the obtained data. The changes in
phenotypic characters (plant height, number of leaves and fresh / dry weight) were
determined in all genotypes due to the reduced water content under drought
conditions. However, tolerant genotypes compared to sensitive genotypes, were
able to conserve photosynthetic activities (absorption/trapping of excitation energy
and utilize efficiently), pigment contents (chlorophyll/carotenoid) and enhance
defense capacity [flavonoids, anthocyanins, glycine betaine, superoxide dismutase
(SOD), ascorbate peroxidase (APX), glutathione reductase (GR), peroxidase (POD)
and aldose reductase (ALR)], thereby the level of H2O2 and stress-induced
membrane damage (MDA) were kept low and were able to provide tolerance to
stress.
In the third stage, the alterations in the protein profiles of tolerant (Tarsan-1018) and
sensitive (Tunca) cultivars and wild Helianthus agrophyllus were proved by
proteomic analysis. 63 proteins were identified in genotypes with MALDI-TOF / TOF
MS / MS mass spectrometry and MASCOT database, and the protein-protein
interaction patterns were performed with STRING database. It has been determined
that the identified proteins are involved in photosynthesis and carbohydrate, energy
and respiration, defense, arginine, nucleotide, fatty acid and glycolipid, protein and
signal metabolism and cell wall biogenesis. Different expression of proteins in
metabolisms and the reductions in nucleotide and protein metabolisms, as well as
protein involved in signal transduction of sensitive cultivar, made Tunca less
successful in stress resistance compared to other genotypes. Tolerant genotypes
were found to exhibit better performance in terms of photosynthesis and carbon
metabolism, as well as protein expression in energy and respiration and fatty acid
and glycolipid metabolisms in the same way, and increased the expression of 14-3-
3 like protein in signal transduction pathway increased resistance to drought
conditions. | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | İÇİNDEKİLER DİZİNİ
Sayfa
ÖZET………………………………………….…………………………………….. i
ABSTRACT…..........…………………………….……………………………….… iii
TEŞEKKÜR………………………………….………………………………….…... v
İÇİNDEKİLER DİZİNİ………………………….…………………………………… vi
ŞEKİLLER DİZİNİ…………………………………………..…............................. xii
ÇİZELGELER DİZİNİ………………………………………………………………. xvi
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ............................................................. xix
1. GİRİŞ……………………………………………………………………………… 1
2. GENEL BİLGİ…………….……………….….………………………………….. 4
2.1. Ayçiçeği….................………………………................................................ 4
2.1.1. Taksonomisi ve Orijini..……..............………...........…………………….. 4
2.1.2. Morfolojisi, Gelişimi ve Ekolojisi……………………….…………………… 5
2.1.3. Ayçiçeği’nin Türkiye ve Dünya’da Ekimi ve Kullanım Alanları …........... 8
2.1.4. Ayçiçeği Gelişimi Etkileyen Stres Faktörleri............................................ 9
2.2. Kuraklık ………………………………......................................................... 11
2.2.1. Bitkilerde Kuraklıkla Meydana Gelen Değişimler…..……………...…..... 13
2.2.1.1. Morfolojik Değişimler........................................................................... 13
2.2.1.2. Mekanik Değişimler………………........................................................ 13
2.2.1.2.1. Su ve İyon Dengesindeki Değişimler................................................. 13
2.2.1.2.2. Membran Yapısında Değişimler…………………………….……....... 14
2.2.1.3. Metabolik Değişimler........................................................................... 14
2.2.1.3.1. Kuraklığın Fotosentetik Aktiviteye Etkisi……………........................ 14
2.2.1.3.1.1. Stomatal Engellemeler……………………...………………............. 15
2.2.1.3.1.2. Stomatal Olmayan Engellemeler................................................... 16
2.2.1.3.2. Kuraklığın Solunum Metabolizması Üzerine Etkisi........................... 16
2.2.1.4. Kuraklıkla İndüklenen Oksidatif Değişimler………............................... 17
2.2.1.4.1. Oksidatif Streste Üretilen ROS’lar…………………………………… 17
2.2.1.4.2. Oksidatif Streste ROS Detoksifikasyonu …………………………….. 19
2.2.1.4.2.1. Enzimatik Antioksidantlar……………………………………………. 19
2.2.1.4.2.2. Enzimatik Olmayan Antioksidantlar………………………………… 22
2.2.2. Kuraklık Stres Toleransında Yer Alan Fonksiyonel Metabolitler…......... 25
vii
2.2.2.1. İşlevsel Proteinler………………………………………………………..... 25
2.2.2.1.1. Akuaporinler…………………………………………………………….. 25
2.2.2.1.2. LEA-tip Proteinler……………………………………………………….. 25
2.2.2.1.3. Isı Şoku Proteinleri (HSP) ………………………………………..……. 27
2.2.2.1.4. Osmolitler………………………………………………………….…….. 27
2.2.2.1.5. Detoksifikasyon Enzimleri…………………………………….……….. 29
2.2.2.2. Düzenleyici proteinler ……………………………………………………. 29
2.2.2.2.1. Protein Kinazlar…………………………………………………………. 29
2.2.2.2.2. Transkripsiyon Faktörleri………………………………………………. 29
2.2.2.2.3. Küçük RNA’lar ………….………………………………………………. 31
2.2.3. Kuraklık ve Fitohormonlar…………………………………………………. 32
2.2.4. Kuraklıkla Meydana Gelen Proteom Değişimleri ……………………….. 32
2.2.4.1. Sinyal İletimi ile İlgili Proteom Değişimleri ……………………………. 36
2.2.4.2. Metabolik Yollarda Meydana Gelen Proteomik Değişimler …………. 37
2.2.4.2.1. Savunma Metabolizması ……………………………………………… 37
2.2.4.2.2. Fotosentez, Fotosolunum ve Karbohidrat Metabolizması ………… 39
2.2.4.2.3. Azot ve Protein Metabolizması …….………………………………… 39
2.2.4.2.4. Yağ Asiti Metabolizması …….…………………………………………. 40
3. MATERYAL ve METOD…..……………….…………………………………… 41
3.1. Bitki materyali…………………………………………………….......……….. 41
3.2. Bitki Yetiştirme Yöntemi……………………………………………………… 41
3.3. I. Aşama: Kuraklığa Toleransın Belirlenmesi………………………………. 42
3.3.1. Bitki Materyali……………………………………………………………….. 42
3.3.2. Uygulamalar…………………………………………………………………. 42
3.3.3. Ölçüm ve Analizler………………………………………………………….. 44
3.3.3.1. Klorofil a Fluoresans Kinetikleri…………………………………………. 44
3.3.3.2. Fizyolojik Ölçümler……………………………………………………….. 49
3.3.3.2.1. Yaprak Nispi Su İçeriğinin Belirlenmesi……………………………… 49
3.3.3.3. Biyokimyasal Ölçümler…………………………………………………… 49
3.3.3.3.1. Yapraklardaki Fotosentetik Pigment İçeriklerinin Belirlenmesi…….. 49
3.3.3.3.2. Yapraklardaki İyon Sızıntısı Oranının Belirlenmesi…………………. 49
3.3.4. Puanlama………………………………………………………………......... 50
viii
3.4. II. Aşama: Seçilen Genotiplerde Kuraklığa Toleransın Ayrıntılı Analizlerle
İncelenmesi………………………………………………………………………….
51
3.4.1. Bitki Materyali……………………………………………………………….. 51
3.4.2. Uygulamalar…………………………………………………………………. 51
3.4.3. Ölçüm ve Analizler………………………………………………………….. 52
3.4.3.1. Morfolojik Ölçümler……………………………………………………….. 52
3.4.3.1.1. Bitki Boyu ve Yaprak Sayısı Ölçümleri……………………………….. 52
3.4.3.1.2. Taze ve Kuru Ağırlık Ölçümleri……………………………………….. 52
3.4.3.2. Fizyolojik Ölçümler…………..…………………………………………… 53
3.4.3.2.1. Yapraklardaki Nispi Su İçeriğinin Belirlenmesi ….………………….. 53
3.4.3.3. Fotosentetik Ölçümler………………………………………………….… 53
3.4.3.3.1. Fotokimyasal Ölçümler………………………………………………… 53
3.4.3.4. Biyokimyasal Ölçümler………………………………………………....... 54
3.4.3.4.1. Yaprak Dokularındaki Fotosentetik Pigment Miktarının Belirlenmesi 54
3.4.3.4.2. Yaprak Dokularında Malondialdehit (MDA) ve Hidrojen Peroksit
(H2O2) Miktarının Belirlenmesi………………………………………….
54
3.4.3.4.3. Yaprak Dokularında Antosiyanin ve Flavonoid İçeriğinin
Belirlenmesi………………………………………………………………
55
3.4.3.4.4. Yaprak Dokularında Glisin Betain İçeriğinin Belirlenmesi ………….. 55
3.4.3.5. Antioksidan Enzim Aktivite Ölçümleri………..……..…………………… 56
3.4.3.5.1. Protein İçeriğinin Belirlenmesi…………………………………………. 56
3.4.3.5.2. Süperoksit Dismutaz (SOD) Aktivitesinin Belirlenmesi……………… 56
3.4.3.5.3. Askorbat Peroksidaz (APX) Aktivitesinin Belirlenmesi…………….... 57
3.4.3.5.4. Glutatyon Redüktaz (GR) Aktivitesinin Belirlenmesi………………… 57
3.4.3.5.5. Peroksidaz (POD) Aktivitesinin Belirlenmesi………………………… 57
3.4.3.5.6. Katalaz (CAT) Aktivitesinin Belirlenmesi…………………………….. 58
3.4.3.5.7. Aldoz Redüktaz (ALR) Aktivitesinin Belirlenmesi…………………… 58
3.4.4. Puanlama………………………………………………………………......... 58
3.5. III. Aşama: Ayçiçeği Proteomundaki Değişimler…………...……………… 60
3.5.1. Bitki Materyali………………………………………………………………... 60
3.5.2. Uygulamalar…………………………………………………………………. 60
3.5.3. Proteomik Analizler……………………………………………………….… 61
3.5.3.1. Toplam Protein Ekstraksiyonu ………………………………………..… 61
ix
3.5.3.2. Proteinlerin Çözdürülmesi ve Toplam Protein Miktarının Tayini…….. 61
3.5.3.3. İki-yönlü poliakrilamid jel elektroforezi (2-D) ……………………….… 62
3.5.3.4. Jellerin Boyanması ve Görüntü Analizi …………………….………… 63
3.5.3.5. Jeldeki Proteinlerin Tripsin ile Kesimi………………………..………… 64
3.5.3.6. Kütle Spektrometresi Analizleri ………………………………………… 64
3.5.3.7. Biyoinformatik Analizler…………………………………………………. 65
3.6. İstatistiksel Analizler…………………………………………………………... 65
4. BULGULAR.................................................................................................. 66
4.1. Tezin I. Aşamasından Elde Edilen Bulgular………………………………... 66
4.1.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Yapraklarda Fotokimyasal Etkinlik … 66
4.1.1.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarındaki
Fotosentetik Performans İndeksi (PIabs)………..………………………
66
4.1.1.2. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarındaki
Fotosentetik Toplam Performans İndeksi (PItop) …………….…………
68
4.1.1.3. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarında İncelenen
Bazı JIP Testi Parametreleri ……………………………………………..
70
4.1.1.4. Kuraklık Faktör İndeksi (KFI) ……………………………………………. 76
4.1.1.4.1. PIabs İçin Kuraklık Faktör İndeksi (KFI) …..…………………..……… 76
4.1.1.4.2. PItop İçin Kuraklık Faktör İndeksi (KFI) ……………………….……... 76
4.1.1.5. İyileşme Faktör İndeksi (IFI) ……………………………………….……. 77
4.1.1.5.1. PIabs İçin İyileşme Faktör İndeksi (IFI)……….……………….………. 77
4.1.1.5.2. PItop İçin İyileşme Faktör İndeksi (IFI) ……………………………..…. 78
4.1.2. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Fizyolojik Ölçümler …..…………..… 78
4.1.2.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Nispi Su İçeriği (NSİ)…. 78
4.1.3. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Biyokimyasal Ölçümler ………….…. 80
4.1.3.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarında
Fotosentetik Pigment İçeriği………………………………………………..
80
4.1.3.1.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarında Toplam
Klorofil (a+b) İçeriği …………………………………………………………
80
4.1.3.1.2. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarında
Karotenoid İçeriği …………………………………………………………...
82
4.1.3.2. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Çeşitlerin Yapraklarında İyon
Sızıntısı………………………………………………………………………
84
x
4.1.4. Analizi Yapılan Parametreler Doğrultusunda Puanlama …….…………. 86
4.2. Tezin II. Aşamasından Elde Edilen Bulgular …………………….………….. 89
4.2.1. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Morfolojik Ölçümler …….……………. 89
4.2.1.1. Bitki Boyu, Tolerans İndeksi ve İyileşme Potansiyelleri ………….…… 89
4.2.1.2. Yaprak Sayısı ………………………………………….………………….. 90
4.2.1.3. Taze Ağırlık, Tolerans İndeksi ve İyileşme Potansiyelleri ….…………. 92
4.2.1.4. Kuru Ağırlık, Tolerans İndeksi ve İyileşme Potansiyelleri …..…………. 93
4.2.2. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Fizyolojik Ölçümler ……………..……. 95
4.2.2.1.Yapraklardaki Nispi Su İçeriğinin Belirlenmesi ………………….……… 95
4.2.3. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Yapraklarda Fotokimyasal Etkinlik…. 96
4.2.3.1. PSII’nin Potansiyel Fotokimyasal Etkinliği (FV/FM) …………….……… 96
4.2.3.2. PSII’de O2 Oluşturan Kompleksin Etkinliği (FV/F0) ………………….… 97
4.2.3.3. PSII’nin Gerçek Fotokimyasal Etkinliği (ФPSII) ………………………... 97
4.2.3.4. PSII’nin Enerji Yakalama Etkinliği (FV'/FM') …………………………….. 98
4.2.3.5. Elektron Taşıma Hızı (ETH) ……………………………………………... 99
4.2.3.6. Işık Enerjisinin Fotokimyasal Kullanımı (qP) …………………………… 100
4.2.3.7. Işık Enerjisinin Fotokimyasal Olmayan Kullanımı (NPQ) ……………... 101
4.2.4. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Biyokimyasal Ölçümler ……………. 102
4.2.4.1.Yaprak Dokularındaki Toplam Klorofil Miktarı ……………………......... 102
4.2.4.2.Yaprak Dokularındaki Toplam Karotenoid Miktarı ……………….…….. 103
4.2.4.3. Malondialdehit (MDA) Miktarı ……………..……………………………. 104
4.2.4.4. Hidrojen peroksit (H2O2) Miktarı …………………………...…………… 105
4.2.4.5. Antosiyanin İçeriği ……………….……………………………………….. 106
4.2.4.6. Flavonoid İçeriği …………………………………………………………... 107
4.2.4.7. Glisin Betain Miktarı …………………………………………………….… 108
4.2.5. Kuraklık ve İyileşme Koşullarında Enzimatik Antioksidan Savunma
Sistemleri…………………………………………………………………….
109
4.2.5.1. Süperoksit Dismutaz (SOD) Aktivitesi.……………………………..…… 109
4.2.5.2. Askorbat Peroksidaz (APX) Aktivitesi ………………...………………… 110
4.2.5.3. Glutatyon Redüktaz (GR) Aktivitesi …………………………………….. 111
4.2.5.4. Peroksidaz (POD) Aktivitesi ……………………………………………... 112
4.2.5.5. Katalaz (CAT) Aktivitesi …………………………………………......…… 114
4.2.5.6. Aldoz Redüktaz (ALR) Aktivitesi …….…………………………………... 115
xi
4.2.6. II. Aşamada Analizi Yapılan Parametreler Doğrultusunda Puanlama…. 116
4.3. Tezin Proteomik Aşamasından Elde Edilen Bulgular ……...……….……… 120
4.3.1. Fotosentez ve Karbohidrat Metabolizması …..…………………………… 121
4.3.2. Enerji ve Solunum Metabolizması ………………………………………… 140
4.3.3. Savunma Metabolizması …………………………………………………… 141
4.3.4. Arjinin Metabolizması ………………………………………………………. 145
4.3.5. Nükleotid Metabolizması …………………………………………………… 145
4.3.6. Yağ Asiti ve Glikolipid Metabolizması ……….……………………………. 145
4.3.7. Protein Metabolizması ……………………………………………….......… 145
4.3.8. Sinyal Metabolizması ………………………………………………………. 149
4.3.9. Hücre Çeper Biyogenezi …………………………………………………… 149
4.3.10. Düşük Peptit Eşleşmesine Sahip Proteinler …………………………….. 149
5. TARTIŞMA................................................................................................... 153
5.1. Ayçiçeği Çeşitlerinin Kuraklığa Tolerans Düzeylerinin Belirlenmesi……… 153
5.2. Seçilen Ayçiçeği Çeşitleri ile Atasal Melezlerin Kuraklık Toleranslarının
Karakterizasyonu………………………………………………………………. 159
5.3. Kuraklık ve İyileşme Uygulamalarında Ayçiçeği Proteomundaki
Değişimler …………………………………………………………………………... 166
6. SONUÇLAR ve ÖNERİLER......................................................................... 179
KAYNAKLAR………......................................................................................... 183
ÖZGEÇMİŞ...................................................................................................... 216 | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Fen Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/restrictedAccess | tr_TR |
dc.subject | Fotosentetik aktivite, iyileşme, kuraklık, proteomik, savunma sistemleri, tolerans, yerel ve atasal ayçiçeği genotipleri | tr_TR |
dc.title | AYÇİÇEĞİ (Helianthus annuus L.) GENOTİPLERİNDE KURAKLIĞA DAYANIKLILIĞIN FİZYOLOJİK, BİYOKİMYASAL VE MOLEKÜLER DÜZEYDE İNCELENMESİ | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | tr_TR |
dc.description.ozet | Bu çalışmada, ülkemizde yetiştirilen tescilli ayçiçeği çeşitleri ile atasal melezler ve
kuraklığa toleranslı olduğu bilinen atasal Helianthus agrophyllus’un kuraklık ve
iyileşme süreçlerinde oluşturdukları yanıtların morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal ve
moleküler (proteom) düzeyde incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın I.
aşamasında ayçiçeği çeşitleri iki farklı şiddette (orta şiddetli-7 gün / şiddetli-9 gün)
kuraklık ve sonrasında iyileşme (sulama- 5 gün) uygulamalarına maruz bırakılmıştır.
Bu aşamada, çeşitlerin fotosentetik aktiviteleri (klorofil a fluoresans ölçümleri),
membran hasarları (iyon sızıntısı), fotosentetik pigment ve su içerikleri ölçülmüştür.
Fotosentetik performans indekslerinden, kuraklık ve iyileşme faktör indeksleri ile
fizyolojik ve biyokimyasal ölçümlerden hasar indeksi ve iyileşme potansiyelleri
hesaplanmıştır. Bu hesaplamalar doğrultusunda çeşitler; kuraklığa toleranslı (Şems,
Sirena, Tarsan-1018), orta derecede toleranslı (Duna, Hornet, Tunca) ve duyarlı
(Bosfora, Coral, Kaan) olmak üzere 3 tolerans düzeyinde sınıflandırılmıştır.
Çalışmanın II. aşamasında, seçilen çeşitler ile birlikte ayçiçeğinin atasal melezleri
(Helianthus annuus x Helianthus agrophyllus ve Helianthus annuus x Helianthus
ii
deserticola) 9 gün kuraklık stresine ve devamında 5 gün iyileşme sürecine maruz
bırakılarak genotiplerin kuraklığa oluşturduğu cevaplar bazı morfolojik, fotosentetik,
fizyolojik ve biyokimyasal parametreler ile ortaya konulmuştur. Elde edilen
verilerinden hasar indeks değerleri ve iyileşme potansiyelleri hesaplanarak
genotipler kuraklık toleranslarına göre karakterize edilmiştir. Kuraklık koşullarında
su içeriğini azalmasına bağlı olarak, tüm genotiplerde fenotipik karakterlerde (bitki
boyu, yaprak sayısı ve taze/kuru ağırlık) değişimler saptanmıştır. Bununla birlikte,
toleranslı genotipler duyarlı genotiplere göre; fotosentetik aktivitelerini ve pigment
içeriklerini (klorofil/karotenoid) koruyup (eksitasyon enerjisini daha iyi yakalayıp
etkin bir şekilde kullanabildiği), savunma kapasitesini [flavonoid, antosiyanin, glisin
betain, süperoksit dismutaz (SOD), askorbat peroksidaz (APX), glutatyon redüktaz
(GR), peroksidaz (POD) ve aldoz redüktaz (ALR)] arttırarak, stresle oluşan
membran hasarı (MDA) ile H2O2 düzeyini düşük tutabilmiş ve strese dayanım
sağlayabilmişlerdir.
Çalışmanın III. aşamasında toleranslı (Tarsan-1018) ve duyarlı (Tunca) olarak
karakterize edilen çeşitler ile atasal Helianthus agrophyllus’un protein profillerindeki
değişimler proteomik analizler ile ortaya konulmuştur. MALDI-TOF/TOF MS/MS
kütle spektrometresi ve MASCOT veri tabanı kullanılarak genotiplerde 63 adet
protein tanımlanmış ve STRING veri tabanı ile protein-protein etkileşim örüntüleri
oluşturulmuştur. Tanımlanan proteinlerin; fotosentez ve karbohidrat, enerji ve
solunum, savunma, arjinin, nükleotid, yağ asidi ve glikolipid, protein ve sinyal
metabolizması ile hücre çeper biyogenezinde görev alan proteinler olduğu
belirlenmiştir. Duyarlı çeşitte, metabolizmalarda tanımlanan proteinlerin farklı yönde
değişmesi ve kuraklıkla birlikte nükleotid ve protein metabolizmaları ile sinyal
iletiminde yer alan protein ifadelerindeki azalmalar, Tunca’yı diğer genotiplere göre
daha az başarılı kılmıştır. Toleranslı genotipler ise fotosentez ve karbon
metabolizmaları ile birlikte enerji ve solunum ile yağ asiti ve glikolipid
metabolizmalarındaki protein ifadelerini benzer yönde düzenleyerek ve sinyal iletim
yolağında yer alan 14-3-3 benzeri protein ifadesini artırarak kuraklık koşullarına
dayanımda daha iyi performans sergiledikleri belirlenmiştir. | tr_TR |
dc.contributor.department | Biyoloji | tr_TR |
dc.contributor.authorID | 55152 | tr_TR |