Show simple item record

dc.contributor.advisorHAYTA, BURCU
dc.contributor.authorAKSU, EVRİM
dc.date.accessioned2017-07-19T13:33:52Z
dc.date.available2017-07-19T13:33:52Z
dc.date.issued2017-07
dc.date.submitted2017-07-07
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11655/3727
dc.description.abstractMitochondrial fusion and fission events, important constituents of mitochondrial quality control mechanisms, are known as mitochondrial dynamics and regulate morphology and function of the organelle. Although mitochondrial dysfunction and dysmorphology have been implicated in the pathogenesis of several different neuromuscular disorders, no studies to date have investigated the potential role of mitochondrial dynamics in the progression of these disorders. In this thesis, the potential role of mitochondrial dynamics in the pathogenesis of Megaconial Congenital Muscular Dystrophy (CMD) has been investigated. Megaconial CMD is characterized by enlarged (megaconial) mitochondria at the periphery of muscle fibers and caused by mutations in the Choline Kinase Beta (CHKB) gene which encodes an enzyme that catalyzes the first step of phosphatidylcholine biosynthesis. In this study, after differentiation of primary myoblasts of Megaconial CMD patient into myotubes, impaired mitochondrial dynamics, localization and morphology were observed by immunofluorescent (IF) staining. Proteins involved in mitochondrial fusion and fission were analyzed by Western Blot and IF analysis. A statistically significant decrease in the expression levels of fission proteins (Drp1, Mff, Fis1) were detected compared to control [as 3.6 (***p<0.0001), 2.1 (***p<0.0001), and 3 fold (**p<0.0025) respectively], but there was no statistically significant difference in the expression levels of fusion proteins (Mfn1, Mfn2, OPA1). Moreover, the results of in-vitro studies were confirmed in skeletal muscle biopsy of a Megaconial CMD patient.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER ONAY SAYFASI iii YAYIMLAMA VE FİKRİ MÜLKİYET HAKLARI BEYANI iv ETİK BEYAN v TEŞEKKÜR vi ÖZET vii ABSTRACT viii ŞEKİLLER xiv 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 4 2.1. Mitokondri ve İşlevleri 4 2.2. Mitokondri ve Kalite Kontrol Mekanizmaları 5 2.3. Mitokondri Dinamiği 6 2.4. Mitokondriyal Füzyon Mekanizması 7 2.5. Mitokondriyal Fisyon Mekanizması 9 2.6. Mitokondriyal Füzyon ve Fisyon Mekanizmalarının Regülasyonu 11 2.7. Megakoniyal Konjenital Müsküler Distrofi Hastalığı 12 2.8. Fosfatidilkolin Sentezi ve Mitokondri ile İlişkisi 14 2.9. Megakoniyal KMD Hastalığının Patogenezinde Mitokondri Dinamiğinin Olası Rolü 15 3. GEREÇLER ve YÖNTEMLER 18 3.1. Gereçler 18 3.1.1. Hücre Kültürü 18 3.1.2. Protein İzolasyonu ve Miktar Tayini 19 3.1.3. SDS Poliakrilamid Jel Elektroforezi (PAGE) 19 3.1.4. Western Blot 20 3.1.5. İmmünfloresan Boyama 22 3.2. Yöntemler 23 3.2.1. Hücre Kültürü 23 3.2.2. Western Blot Analizi 24 3.2.3. Primer Hücrelerde İmmünfloresan Boyama 28 3.2.4. Doku Kesitlerinde İmmünfloresan Boyama 29 x 3.2.5. Verilerin Değerlendirilmesi ve İstatistiksel Analiz 30 4. BULGULAR 31 4.1. Primer Miyoblast Hücre Kültürü ve Miyoblastların Miyotüplere Farklılaştırılması 31 4.2. Megakoniyal KMD Hastasına Ait Primer Hücrelerde Mitokondri Ağının IF Boyama ile Analizi 33 4.3. Megakoniyal KMD Hastasına Ait Primer Hücrelerde Hasarlı Mitokondri Yerleşiminin Konfokal Mikroskobu ile Analizi 36 4.4. Megakoniyal KMD Hastasına Ait Primer Hücrelerinde Mitokondriyal Füzyon/Fisyon Proteinlerinin Western Blot Analizi 38 4.5. Megakoniyal KMD ve Kontrol Primer Hücrelerinde Mitokondriyal Fisyon Proteinlerinin IF Boyama ile Analizi 40 4.6. Megakoniyal KMD ve Kontrol İskelet Kas Dokusunda Mitokondri Ağının IF Boyama ile Analizi 44 4.7. Megakoniyal KMD ve Kontrol İskelet Kas Biyopsi Örneklerinden Alınan Kesitlerde Mitokondriyal Fisyon Proteinlerinin IF Boyama ile Analizi 44 5. TARTIŞMA 49 6. SONUÇ ve ÖNERİLER 56 6.1. Sonuçlar 56 6.2. Öneriler 57 7. KAYNAKLAR 59 8. EKLER EK 1: Tez Çalışması İle İlgili Etik Kurul İzni 9. ÖZGEÇMİŞtr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherSağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectMegakoniyal Konjenital Müsküler Distrofitr_TR
dc.subjectmitokondri dinamiği
dc.subjectmitokondriyal fisyon
dc.subjectmitokondriyal füzyon
dc.titleMegakoniyal Konjenital Müsküler Distrofi Hastalığında Mitokondri Dinamiğinin İncelenmesitr_TR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesistr_TR
dc.description.ozetMitokondri kalite kontrolünün önemli bileşenleri olarak kabul edilen füzyon ve fisyon mekanizmaları mitokondri dinamiği olarak tanımlanmakta ve organel morfolojisini ve işlevini düzenlemektedirler. Farklı genetik temelleri olan birçok nöromüsküler hastalığın patogenezinde mitokondri işlev ve morfoloji kaybı gözlenmiş olmasına rağmen, mitokondriyal füsyon ve fisyon mekanizmalarının bu hastalıkların patolojik sürecine etkisi günümüze kadar araştırılmamıştır. Tez çalışmasında; fosfatidilkolin sentezinden sorumlu enzimlerden ilkini kodlayan Kolin Kinaz Beta (CHKB) genindeki mutasyonlar sonucu ortaya çıkan ve sarkolemmaya yakın yerleşimli aşırı büyük (megakoniyal) mitokondriler ile karakterize nadir nöromüsküler hastalıklardan Megakoniyal Konjenital Müsküler Distrofi (KMD)’nin patogenezinde mitokondri dinamiğinin olası rolü araştırılmıştır. Tez kapsamında, Megakoniyal KMD hastasına ait primer miyoblast hücreleri uygun koşullarda miyotüplere farklılaştırılmış ve immünfloresan (IF) boyamalar ile mitokondri morfolojisinin, yerleşiminin ve dinamik ağ yapısının bozulduğu gözlenmiştir. Mitokondriyal füzyon/fisyonda görevli temel proteinler Western Blot ve IF boyamalar ile kontrol hücrelerle karşılaştırmalı olarak analiz edilmiş olup, mitokondriyal füzyon proteinlerinin (Mfn1, Mfn2, OPA1) seviyesinde kontrole göre herhangi bir değişim saptanmazken, fisyonda görevli temel proteinlerin (Drp1, Mff, Fis1) ifadelerinin istatistiksel olarak anlamlı düzeyde azaldığı [sırasıyla 3.6 (***p<0,0001), 2.1 (***p<0,0001) ve 3 kat (**p<0,0025)] sonucuna ulaşılmıştır. Megakoniyal KMD hastasına ait iskelet kas biyopsisinden alınmış olan kesitlerde in-vitro çalışmalardan elde edilen sonuçlar doğrulanmıştır.tr_TR
dc.contributor.departmentTıbbi Biyolojitr_TR


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record