dc.contributor.advisor | Müftüoğlu, Sevda Fatma | |
dc.contributor.author | Ilgın, Can | |
dc.date.accessioned | 2017-03-09T05:55:50Z | |
dc.date.available | 2017-03-09T05:55:50Z | |
dc.date.issued | 2017 | |
dc.date.submitted | 2017-02-23 | |
dc.identifier.citation | Vancouver | tr_TR |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/3252 | |
dc.description | Tezimin 03.03.2019 tarihine kadar erişime açılmasını istemiyorum ancak kaynak gösterilmek şartıyla bir kısmı veya tamamının fotokopisinin alınmasını onaylıyorum. | tr_TR |
dc.description.abstract | Breast cancer is a heterogeneous disease with different molecular subtypes, which determine the prognosis and response to the treatment. CD133 is a marker for cancer stem cells in tumor microenvironment with diagnostic/therapeutic importance. The tumor associated macrophages (TAM) interact with the cancer stem cells through the CXCR1 receptor. In this study, we hypothesized a possible difference in distribution of CD133, CXCR1 and CD163 antigens among different subtypes of breast cancer. Thus, we investigated the expression of these antigens in samples of the patients with luminal A (LA), luminal B (LB), HER2 overexpression (HER2OE), triple negative (TN) subtypes of breast cancer and control patients without cancer diagnosis. We applied indirect immunohistochemistry and evaluated immunostaining. CD133 expression was at periphery and CXCR1 expression was at the central areas of the tumor clusters. Cytoplasmic CXCR1, CD133 expressions and nuclear CD133 expression (prominent in TN subtype) were observed in patients. There was a statistically significant difference between groups for CD133 (p=0.004), CXCR1 (p=0.002) H-Score and M2 macrophages/whole TAM ratios (p=0.022). Between CD133 and CXCR1 expressions, there was a weak positive correlation (r=0.249, p=0.035). Due to compartment specific expression, agents targeting CXCR1 should reach to the central area of the tumor mass. Patients with TN subtype would benefit more from anti-CXCR1 treatment. Treatments, which target CXCR1 can also lower the expression of CD133 and vice versa.
Keywords: Breast cancer, molecular subtypes, microenvironment, CD133, CXCR1, CD163, tumor associated macrophages, cancer stem cell | en |
dc.description.sponsorship | Bu çalışma Öğretim Üyesi Yetiştirme Programı (ÖYP) ile desteklenmiştir. | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | ONAY SAYFASI iii | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | YAYIMLAMA VE FİKRİ MÜLKİYET HAKLARI BEYANI iv | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | ETİK BEYAN v | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | TEŞEKKÜR vi | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | ÖZET vii | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | ABSTRACT viii | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | İÇİNDEKİLER ix | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | SİMGELER VE KISALTMALAR xiii | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | ŞEKİLLER xvii | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | TABLOLAR xxi | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 1.GİRİŞ 1 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2. GENEL BİLGİLER 3 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.1. Kanser Kök Hücreleri 3 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.1.1. Meme Kanseri Kök Hücrelerinin Kökeni 4 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.1.2.Meme Kanseri Kök Hücre İşaretçileri 5 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.1.3.Meme Kanseri Kök Hücrelerinin Özellikleri 7 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.2. Meme Kanseri Kök Hücresi Mikroçevresi 10 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.2.1. Meme Kanseri Kök Hücresi Mikroçevresinde Bulunan Hücreler 10 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.2.2. Meme Kanseri Kök Hücresinin Mikroçevresinden Kaynaklanan Sinyaller 11 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.2.3. Meme Kanserinin Moleküler Alt Tiplerinde Sinyal Molekülü Dağılımı 15 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.3. Meme Kanseri Mikroçevresinde Tümörle İlişkili Makrofajlar (TAM) 16 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 2.3.1. Tümörle İlişkili Makrofajların (TAM) Meme Kanseri Kök Hücreleri ile Etkileşimi 18 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.GEREÇ VE YÖNTEM 20 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.2. Hastane Veri Tabanının Taranması 20 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.3. Çoklu Blokların Taranması 21 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.4. Kesitlerin Alınması 21 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5. İmmunohistokimya Yönteminin Uygulanması 22 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.1. Deparaffinizasyon ve Rehidratasyon 22 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.2. Antijen Geri Çağırma 22 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.3. Tampon Solüsyonu ile Yıkama 23 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.4. Normal Serum ile Blokaj 23 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.5. Primer antikorun uygulanması 24 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.6. H₂O₂ ile blokaj 25 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.7. Sekonder antikorun uygulanması 25 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.8. Kromojen uygulanması 26 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.9.Çekirdek boyası uygulanması 26 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.5.10. Dehidratasyon, şeffaflama ve kapama 27 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.6. Spesimenlerin Görüntülenmesi 27 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.7. İmmünohistokimya ile Boyanmanın Değerlendirilmesi 28 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 3.8. İstatistik Analiz 28 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.BULGULAR 30 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.1. Kanser ve Kontrol Grubunun Demografik Özellikleri 30 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.2. Hastaların CD133, CXCR1 ve CD163 İmmunohistokimya Görüntülerinin Histopatolojik Olarak Değerlerlendirilmesi 32 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.2.1. Kanser ve Kontrol Grubu Hastalarına Ait Meme Dokularında CD133 Ekspresyonu 33 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.2.2. Kanser ve Kontrol Grubu Hastalarına Ait Meme Dokularında CD163 Ekspresyonu 41 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.2.3. Kanser ve Kontrol Grubuna Ait Meme Dokularında CXCR1 Ekspresyonu 47 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.3. Kanser ve Kontrol Grubunun ER, PR,HER2 Durumları ve Ki67 indeksi 53 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.4. Hastaların CD133 Ekspresyonu Açısından Değerlendirilmesi 55 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.5. Hastaların M2 Makrofaj Dağılımı Açısından Değerlendirilmesi 58 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.6 Hastaların CXCR1 Ekspresyonu Açısından Değerlendirilmesi 61 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.7. Hastaların CD133 H-Skoru, M2/TM Oranı ve CXCR1 H-Skoru Değerlerinin Birbirleriyle İlişkisinin İncelenmesi 64 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.8. Hastaların ER Ekspresyon Durumlarının CD133, M2/TM Oranı ve CXCR1 Ekspresyon Durumlarıyla İlişkisinin İncelenmesi 66 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.9. Hastaların PR Ekspresyon Durumlarının CD133, M2/TM Oranı ve CXCR1 Ekspresyon Durumlarıyla İlişkisinin İncelenmesi 75 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.10. Hastaların HER2 Ekspresyon Durumlarının CD133, M2/TM Oranı ve CXCR1 Ekspresyon Durumlarıyla İlişkisinin İncelenmesi 84 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.11. Hastaların Ki67 indekslerinin CD133, M2/TM Oranı ve CXCR1 Ekspresyon Durumlarıyla İlişkisinin İncelenmesi 93 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.12. Lüminal ve Lüminal Olmayan Moleküler Alt Tipteki HastalarınCD133 Ekspresyon Durumu, M2/TM, M2/M1 Oranları ve CXCR1 Ekspresyon Durumları 102 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 4.13. Triple Negatif ve Triple Negatif Olmayan Moleküler Alt Tipteki Hastaların CD133 Ekspresyon Durumu, M2/TM, M2/M1 Oranları ve CXCR1 Ekspresyon Durumları 111 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.TARTIŞMA 119 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.1. Hastaların Demografik Özellikleri 119 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.2. Hastaların Histopatolojik Özelliklerinin Değerlendirilmesi 120 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.3. Hastaların ER, PR, HER2 Durumları ve Ki67 indeksleri 122 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.4. Hastaların CD133, CXCR1 Ekspresyon Durumları ve M2/TM, M2/M1 oranları 123 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.5. Hastaların CD133, CXCR1 Ekspresyon Durumları ve M2/TM Oranları Arası İlişkiler 126 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.6. Hastaların ER, PR, HER2 Durumları ve Ki67 indekslerinin CD133, CXCR1 Ekspresyon Durumu ve M2/MF-M2/M1 Oranlarıyla İlişkisi 127 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.7. Lüminal ve Lüminal Olmayan Hastaların CD133, CXCR1 Ekspresyon Durumu ve M2/MF-M2/M1 Oranları 130 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 5.8. TN ve TN Olmayan Hastaların CD133, CXCR1 Ekspresyon Durumu ve M2/MF-M2/M1 Oranları 132 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 6. SONUÇLAR 134 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 7. KAYNAKLAR 136 | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 8. EKLER | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | EK-1. Tez Çalışması ile İlgili Etik Kurul İzni | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | 9. ÖZGEÇMİŞ | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
dc.subject | Moleküler alt tip | tr_TR |
dc.subject | Mikroçevre | tr_TR |
dc.subject | CD133 | tr_TR |
dc.subject | CXCR1 | tr_TR |
dc.subject | CD163 | tr_TR |
dc.subject | Tümörle ilişkili makrofajlar | tr_TR |
dc.subject | Kanser kök hücresi | tr_TR |
dc.subject | Meme kanseri | tr_TR |
dc.title | Meme Kanserinin Farklı Moleküler Alt Tiplerinin Kök Hücre İşaretçisi, Sitokin Reseptörü ve Tümörle İlişkili Makrofaj İşaretçisi Dağılımı Açısından Değerlendirilmesi | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | tr_TR |
dc.description.ozet | Meme kanseri prognoz ve tedaviye cevabı belirleyen farklı moleküler alt tipleri olan heterojen bir hastalıktır. Tümör mikroçevresindeki kök hücreler için işaretçi olan CD133'ün tanı ve tedavide önemi vardır. Tümörle ilişkili makrofajlar (TAM), kanser kök hücreleriyle CXCR1 aracılığıyla etkileşir. TAM’lar, M1 ve işaretçisi CD163 olan M2 fenotiplerine ayrılır. Bu çalışmada hipotezimiz, meme kanserinin farklı moleküler alt tiplerinde CD133, CXCR1 ve CD163 antijenlerinin ekspresyonları arası fark olduğudur. Bu nedenle meme kanserinin lüminal A (LA), lüminal B (LB), HER2 aşırı eksprese eden (HER2AE), triple negatif (TN) alt tiplerinde ve kanser tanısı almamış kontrol hastalarında bu antijenlerin ekspresyonları incelenmiştir. Bu amaçla hasta örneklerine indirekt immünohistokimya yöntemi uygulanmıştır. CD133 ekspresyonu tümör kitlesinin periferinde, CXCR1 ekspresyonu ise daha çok tümörün merkezi bölgelerinde görülmüştür. Sitoplazmik ve nükleer CD133, sitoplazmik CXCR1 ekspresyonları gözlemlenmiştir. Grupların CD133 (p=0.004), CXCR1 (p=0.002) ve M2/tüm makrofaj oranları (p=0.022)arasında istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmıştır. CD133 ve CXCR1 ekspresyonları arasında, zayıf pozitif korelasyon saptanmıştır (r=0.249, p=0.035). Sonuç olarak, düşük CD133 ekspresyonu TN alt tipteki hücrelerin düşük farklanma seviyesi ile açıklanabilir. Kompartmana spesifik ekspresyon nedeniyle CXCR1'i hedefleyen ilaçların tümörün merkezi bölgelerine ulaşması gerekir. TN moleküler alt tipteki hastalar, CXCR1'i hedefleyen ilaçlardan daha çok fayda görecektir. CXCR1'i hedefleyen ilaçlar, CD133 ekspresyonunu da azaltabilir. | tr_TR |
dc.contributor.department | Histoloji ve Embriyoloji | tr_TR |
dc.contributor.authorID | TR184743 | tr_TR |