dc.contributor.advisor | Boyacı, İsmail Hakkı | tr_TR |
dc.contributor.author | Şöföroğlu, Mehmet | tr_TR |
dc.date.accessioned | 2015-10-15T08:50:52Z | |
dc.date.available | 2015-10-15T08:50:52Z | |
dc.date.issued | 2013 | tr_TR |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/2763 | |
dc.description.abstract | Within the scope of this study, development of a sensitive deoxyribonucleic acid
(DNA) biosensor by using surface enhance Raman spectroscopy (SERS) technique
was studied. For this purpose two kinds of magnetic nanoparticles (Gold coated
magnetic sphere and silica coated 3-aminopropyltriethoxysilane (APTS) modified
magnetic nanoparticle) were used. Besides all these, gold nanorods which were
become SERS active by coating with one of the SERS label molecule 5,5-dithiobis
(2-Nitrobenzoic acid) (DTNB) and thus enables the detection of target sequences
were used. In the first step of the study, all of the parameters in each step were
optimized to ensure proper surface modifications for the nanoparticles and get the
most out of the edited system. After that a system that is called ‘sandwich assay’ was
applied for rapid, selective and sensitive detection of genetic modified organisms
(GMO). According to the system magnetic particles coated with target specific probes
were enabled selective seperation of the target sequence from the media and DTNB
coated nanorods made it possible to detect target sequence by following the
symmetric NO2 stretching band that incident to DTNB molecule. To obtain calibration
curve from the system that developed for GMO analysis, it was studied between 50-
1000 nM target sequence molarities and R2
between the band intensities was 0,955. | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Fen Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
dc.subject | SERS | tr_TR |
dc.title | Yüzeyde Güçlendirilmiş Raman Spektroskopisi Tekniği Kullanılarak Hedef Dna Dizi Tayini | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | tr_TR |
dc.callno | 2013/47 | tr_TR |
dc.contributor.departmentold | Gıda Mühendisliği | tr_TR |
dc.description.ozet | Bu çalışma kapsamında yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi (YGRS)
tekniği kullanılarak hassas deoksiribonükleik asit (DNA) biyosensörü geliştirilmesi
üzerine çalışılmıştır. Bu amaçla farklı özelliklere sahip iki manyetik partikül (Altın kaplı
manyetik küre ve silika kaplı 3-aminopropiltrietoksisilan (APTS) modifiyeli manyetik
nanopartikül) kullanılmıştır. Bunların yanında, YGRS etiketi olan 5,5-dithiobis (2-
Nitrobenzoik asit) (DTNB) ile kaplanarak YGRS aktif hal getirilen ve bu sayede hedef
dizilim varlığının saptanmasına olanak sağlayan altın nanoçubuklar kullanılmıştır.
Çalışmada ilk adım olarak kullanılacak tüm partiküllerin yüzey modifikasyonlarını en
düzgün şekilde yapabilmek ve ardından kurgulanan sistemden en iyi şekilde
yararlanabilmek adına deney basamaklarındaki parametrelerin optimizasyonu
yapılmıştır. Ardından genetik modifiye organizmaların (GMO) hızlı, seçici ve hassas
bir şekilde analiz edilebilmesi amacıyla ‘sandviç analizi’ olarak bilinen sistem
uygulanmıştır. Bu sisteme göre hedef dizilime spesifik problarla modifiye edilmiş
manyetik partikül, hedef dizilimin ortamdan seçici olarak ayrımına olanak sağlarken;
DTNB ile kaplanmış altın nanoçubuklar ise DTNB molekülüne ait olan simetrik NO2
gerilmesine ait bant üzerinden gidilerek hedef dizilimin tayinine olanak sağlamaktadır.
GMO analizine yönelik geliştirilen sisteme ait oluşturulan kalibrasyon eğrisinde 50-
1000 nM aralığında çalışılmış ve elde edilen bant şiddetleri arasındaki R2
değeri
0,955 olarak bulunmuştur. | tr_TR |