dc.contributor.advisor | Özmen, Füsun | |
dc.contributor.author | Narin Şimşek, Ceren | |
dc.date.accessioned | 2022-07-29T11:10:50Z | |
dc.date.issued | 2022-07-29 | |
dc.date.submitted | 2022-06-30 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/26654 | |
dc.description.abstract | Pancreatic cancer is an aggressive malignancy with a poor prognosis. Early diagnosis and application of tumor-specific treatment are very important in pancreatic cancer. Therefore, new biomarkers are needed in the diagnosis and treatment of tumors. Micro RNAs (miRNAs), also known as non-protein-coding RNAs, are endogenous RNAs targeted as cancer biomarkers. miRNAs cause low specificity binding of the target gene to messenger RNAs (mRNA), mRNA degradation and translational inhibition, and play important roles in the control of gene expression. In this study, the relationship between miR-200a-3p, which acts as a tumor suppressor, and one of its target genes, Mitochondrial Transcription Factor A (TFAM), was examined at the gene expression level. TFAM is considered a binding chaperone in packaging nucleotides of mitochondrial DNA (mtDNA) and is required for mtDNA replication and transcription. It is known that the TFAM gene is overexpressed in many tumors and shows oncogene character. In our study, miR-200a-3p gene expression was increased by mimic transfection in Panc-1 and Miapaca-2 pancreatic cancer cell lines with low miR-200a-3p gene expression levels. It was shown that TFAM gene expression, which is highly expressed in pancreatic cancer cell lines, decreased with the increase of miR-200a-3p gene expression. It was found that there was a negative correlation between increased miR-200a-3p gene expression and cell viability and a positive correlation between late apoptosis. As a result of mimic miR-200a-3p transfection, its proliferation in the Panc-1 cell line was found to be decreased. These findings showed that TFAM, which is one of its target genes and associated with poor prognosis, is regulated at the transcriptional levels by modulation of miR-200a-3p expression in pancreatic cancer as a result of mimic or inhibitor application and miR-200a-3p can be a target biomarker. | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Kanser Enstitüsü | tr_TR |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
dc.subject | Pankreas kanseri | tr_TR |
dc.subject.lcsh | Biyokimya. Hücre biyolojisi. Hücre genetiği | tr_TR |
dc.title | Pankreas Kanseri Hücre Hattında TFAM Ekspresyon Düzeyinin Hücre Fonksiyonları Üzerine Etkisi | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | tr_TR |
dc.description.ozet | Pankreas kanseri agresif, kötü prognoz ile seyreden malignitelerdendir. Erken tanısı ve tümöre özgü tedavinin uygulanması pankreas kanseri tümörlerinde oldukça önemlidir. Tanı ve tedavide bu nedenle yeni biyobelirteçlere gereksinim duyulmaktadır. Protein kodlamayan RNA’lar olarak da bilinen mikro RNA’lar (miRNA), kanser biyobelirteçleri olarak hedeflenen endojen RNA’lardır. Mitokondriyal Transkripsiyon Faktör A (TFAM), mitokondriyal DNA’nın (mtDNA) nükleotitlerinin paketlenmesinde rol alan bağlayıcı şaperondur ve mtDNA replikasyonu ve transkripsiyonu için gereklidir. TFAM geninin birçok tümörde aşırı eksprese edildiği ve onkogen karakter gösterdiği bilinmektedir. Bu çalışmada, tümör baskılayıcı olarak görev yapan miR-200a-3p ile hedef genlerinden biri olan TFAM arasındaki ilişki gen ekspresyonu düzeyinde incelenmiş ve TFAM’ın hücre proliferasyonu ve apoptozis üzerine olan etkisi araştırılmıştır. Çalışmamızda, miR-200a-3p gen ekspresyonun düşük düzeyde olduğu Panc-1 ve Miapaca-2 pankreas kanseri hücre hatlarında saptandı ve miR-200a-3p gen ekspresyonu mimik miR-200a-3p transfeksiyonu ile arttırıldı. miR-200a-3p gen ekspresyonunun artmasıyla pankreas kanseri hücre hatlarında yüksek düzeyde eksprese edilen TFAM gen ekspresyonunun azaldığı gösterildi. Panc-1 hücre hattında, TFAM’ın azalması ile birlikte hücre canlılığında ve proliferasyonda azalma, geç apoptozis ve hücre nekrozunda ise artış tespit edildi. Sonuç olarak Panc-1 hücre hattında miR-200a-3p gen ekspresyonunun artışı ile hücre canlılığı arasında negatif, geç apoptoz arasında ise pozitif korelasyon olduğu ilk kez bu çalışma ile gösterilmiş oldu. Elde edilen bu bulgular, pankreas kanserinde miR-200a-3p ekspresyonunun mimik veya inhibitör uygulaması sonucu modülasyonu ile hedef genlerinden biri olan ve kötü prognoz ile ilişkili TFAM’ın transkripsiyonel düzeyde düzenlendiğini ve miR-200a-3p’nin bir hedef biyobelirteç olabileceğini göstermiştir. | tr_TR |
dc.contributor.department | Temel Onkoloji | tr_TR |
dc.embargo.terms | Acik erisim | tr_TR |
dc.embargo.lift | 2022-07-29T11:10:50Z | |
dc.funding | Yok | tr_TR |
dc.subtype | annotation | tr_TR |
dc.subtype | image | tr_TR |