Show simple item record

dc.contributor.advisorÖzüdoğru, Barış
dc.contributor.authorCan, Ilgın Deniz
dc.date.accessioned2020-09-17T10:01:59Z
dc.date.issued2020
dc.date.submitted2020-08-06
dc.identifier.citationCan, I.D., Yüksek Çözünürlüklü Genomik Veri ve Numerik Taksonomik Yöntemlerle Noccaea aucheri (Brassicaceae) Tür Kompleksi için Tür Sınırlandırması, Yüksek lisans tezi, Hacettepe Üniversitesi Fen Bilimleri Fakültesi, 2020.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11655/22679
dc.description.abstractIn this study, species limits of N. aucheri species complex which is endemic to serpentine areas of Turkey and transferred from Pseudosempervivum to Noccaea recently were investigated. High-throughput genomic data and numeric taxonomical methods have been used together with the field studies carried out to accurately draw the boundaries of the species in the complex, to solve taxonomic problems, and to update suspiciously distribution data. Study materials were obtained from both field and herbarium studies. For numeric taxonomical analysis, in addition to the characters given in the literature and used to distinguish these species, many different characters have been measured and studied. In addition, coalescent-based phylogenomic analyzes and species delimitation methods were performed at the population level with 200 loci sequenced randomly from different regions of the genome using the restriction site associated DNA markers (RADseq) sequencing method. All results were integrating with morphological, geographic, and also ecological data and eventually, it has been found that the members of this species complex represent a single polymorphic species. As a result, N. mummenhoffiana and N. sempervivum were placed under the name N. aucheri because of the priority rule, and the new description was prepared for this polymorphic species.tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherFen Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectBrassicaceaeatr_TR
dc.subjectNumerik taksonomi
dc.subjectNoccaea
dc.subjectRADseq
dc.subjectTür sınırlandırması
dc.subject.lcshBotaniktr_TR
dc.titleYüksek Çözünürlüklü Genomik Veri ve Numerik Taksonomik Yöntemlerle Noccaea aucheri (Brassicaceae) Tür Kompleksi için Tür Sınırlandırmasıtr_TR
dc.title.alternativeSpecıes Delımıtatıon of Noccaea Aucherı (Brassıcaceae) Specıes Complex Usıng Hıghthroughput Genomıc Data and Numerıcal Taxonomy
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesistr_TR
dc.description.ozetBu çalışma kapsamında Türkiye’nin serpantin bölgelerine endemik ve kısa bir süre önce Pseudosempervivum cinsinden Noccaea cinsine transfer edilmiş üç türü (N. aucheri, N. mummenhoffiana ve N. sempervivum) içeren N. aucheri Tür Kompleksi’nin tür sınırları incelenmiştir. Kompleks içerisindeki türlerin sınırlarını kesin bir şekilde çizebilmek, taksonomik problemleri gidermek, hatalı dağılım verilerini güncellemek için gerçekleştirilen arazi çalışmalarıyla birlikte, yüksek çözünürlüklü genomik veri ve numerik taksonomik yöntemler kullanılmıştır. Çalışma materyalini oluşturan örnekler, çalışma kapsamında gerçekleştirilen arazi çalışmalarından ve çeşitli herbaryumlardan temin edilmiştir. Numerik taksonomik analizler için, literatürde verilen ve bu türlerin ayrımında kullanılan karakterlere ek olarak birçok farklı karakter ölçülmüş ve incelenmiştir. Bunun yanı sıra Restriction site associated DNA markers (RADseq) dizileme yöntemiyle tüm genomun farklı bölgelerinden rastgele dizilenmiş 200 lokusla popülasyon seviyesinde gerçekleştirilen çok türlü koalesent tabanlı filogenomik analizler ve tür sınırlandırma analizlerinin morfolojik, coğrafi ve ekolojik bilgilerle değerlendirilmesi sonucunda bu tür kompleksini oluşturan türlerin tek bir poliformik türü temsil ettiği anlaşılmıştır. Sonuç olarak; N. mummenhoffiana ve N. sempervivum türlerinin öncelik kuralı gereği N. aucheri türünün sinonimi olarak değerlendirilmesi önerilmiş ve bu polimorfik tür için yeni bir betim hazırlanmıştır.tr_TR
dc.contributor.departmentBiyolojitr_TR
dc.embargo.termsAcik erisimtr_TR
dc.embargo.lift2020-09-17T10:01:59Z
dc.fundingYoktr_TR


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record