dc.contributor.advisor | Tacal, Özden | tr_TR |
dc.contributor.author | Biberoğlu, Kevser | tr_TR |
dc.date.accessioned | 2015-10-14T12:35:07Z | |
dc.date.available | 2015-10-14T12:35:07Z | |
dc.date.issued | 2014 | tr_TR |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11655/1173 | |
dc.description.abstract | Acetylcholinesterase (AChE) in the serum of fetal bovine is a tetrameric
enzyme. The related enzyme, butyrylcholinesterase (BChE), in the sera of humans
and horse requires polyproline peptides for assembly into tetramers. The goal of this
study was to determine whether soluble tetrameric AChE includes tetramer
organizing peptides in its structure. In this study, fetal bovine serum AChE was
denatured by boiling to release non-covalently bound peptides. Released peptides
were separated from bulk protein by filtration and by high performance liquid
chromatography. Peptide mass and amino acid sequence of the released peptides
were determined by MALDI–TOF–TOF and LTQ-Orbitrap mass spectrometry.
Fourteen polyproline peptides, divided into 5 families, were identified. The longest
peptide contained 25 consecutive prolines and no other amino acid. Other
polyproline peptides included one nonproline amino acid. A search of the
mammalian proteome database suggested that this assortment of polyproline peptides
originated from at least 5 different precursor proteins, none of which were the ColQ
or PRiMA of membrane-anchored AChE. To date, AChE and BChE are the only
proteins known that include polyproline tetramer organizing peptides in their
tetrameric structure. | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.publisher | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
dc.subject | Fetal bovine serum acetylcholinesterase | tr_TR |
dc.title | Fetal Sığır Serum Asetilkolinesterazının Tetramerik Yapısını Organize Eden Poliprolin Peptidlerin Kütle Spektrometre ile Analizi | tr_TR |
dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | tr_TR |
dc.callno | 2014/1532 | tr_TR |
dc.contributor.departmentold | Biyokimya Anabilim Dalı | tr_TR |
dc.description.ozet | Fetal sığır serumunda bulunan asetilkolinesteraz (AChE), tetramerik yapıda bir
enzimdir. İnsan ve at serumunda bulunan ve AChE ile ilişkili bir enzim olan
bütirilkolinesterazın (BChE) tetramerik yapıya dönüşmesinde poliprolin peptidlerin
rolü bilinmektedir. Bu çalışmanın amacı, çözünür, tetramerik AChE’ın yapısında
tetramer yapıyı organize eden peptidlerin olup olmadığını incelemektir. Çalışmada
öncelikle fetal sığır serum AChE’ı, kaynatılarak denatüre edildi ve böylece nonkovalent
bağlı peptidlerin AChE’dan salınmasına izin verildi. Peptidler, daha sonra
ana proteinden filtrasyon ve HPLC yöntemleri kullanılarak saflaştırıldı. Salınan
peptidlerin kütlesi ve amino asit dizisi, MALDI–TOF–TOF ve LTQ-Orbitrap kütle
spektrometresi ile belirlendi. Çalışmanın sonunda 5 aile içerisinde sınıflandırılan
ondört poliprolin peptid tanımlandı. Çalışılan peptidlerden en uzun peptidin, başka
bir amino asit olmaksızın 25 tane ardışık prolin aminoasiti içerdiği bulundu. Diğer
poliprolin peptidlerin yapısında ise bir adet farklı bir amino asitin bulunduğu
gözlendi. Memeli proteom veritabanında yapılan araştırma sonucunda poliprolin
peptidlerin, en azından 5 farklı prekürsör proteinden kaynaklandığı ve onların
membrana-bağlı AChE’ın ColQ veya PRiMA’dan bağımsız olduğu bulundu.
Günümüze kadar, AChE ve BChE, yapılarında tetramer yapıyı oluşturan poliprolin
peptidleri içerdiği bilinen iki proteindir. | tr_TR |