Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisorÖzyavuz Alp, Şehnaz
dc.contributor.authorKarahan, Gizem
dc.date.accessioned2022-03-21T06:27:00Z
dc.date.issued2022-03-17
dc.date.submitted2021-10-10
dc.identifier.citationT.C. HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ ENFEKSİYON HASTALIKLARI ve KLİNİK MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI, SİTOMEGALOVİRÜS GASTROİNTESTİNAL HASTALIĞININ TANISINDA PLAZMADA CMV VİRÜS YÜKÜ EŞİK DEĞERİ ELDE EDİLMESİ, TESTİN TANISAL PERFORMANS ÖLÇÜTLERİNİN BELİRLENMESİ VE HASTALIĞI TAHMİN ETMEYE YÖNELİK SKORLAMA SİSTEMİ GELİŞTİRİLMESİ, Dr. Gizem KARAHAN, Tıpta Uzmanlık Tezi, ANKARA, 2021tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11655/25996
dc.description.abstractCytomegalovirus (CMV) is a DNA virus belonging to the Herpesviridae family. In healthy individuals, CMV usually causes an asymptomatic infection or a mild illness. After primary infection, CMV remains in a latent state in tissues and organs and can be reactivated in the presence of particular circumstances, and reinfection may also occur. A more severe course of CMV infection, tissue and organ involvement can be developed in individuals with severe immunosuppression such as transplant recipients and those with acquired immunodeficiency syndrome due to the immunosuppressive medications or the disease itself. End-organ involvement is usually reported in the retina, gastrointestinal system, central nervous system, liver, and lungs. Cytomegalovirus gastrointestinal disease (CMV-GID) can involve any area of the epithelium lining the gastrointestinal tract mucosa, from the mouth to the anus. Accurate and early diagnosis is very important because it can lead to life-threatening consequences such as bleeding and perforation. The gold standard for the diagnosis of CMV-GID is demonstration of histopathological findings related to CMV in endoscopic biopsy or surgically removed tissue specimens, and confirmation of the diagnosis, if possible, by immunohistochemical examination. Difficulty or delay in diagnosis may be experienced due to the need for an invasive procedure to obtain the tissue sample; the presence of conditions that may hinder intervention in some patients; the patient's refusal to give consent for the interventional procedure; and the turnaround time for histopathological examination reports. There is a need for non-invasive and early yielding methods and approaches that can predict the diagnosis of CMV-GID with optimal diagnostic performance measures that can guide the preemptive treatment decision while pending histopathological examination results. It is emphasized that the detection of CMV viral load in plasma with polymerase chain reaction (PCR) as a method that does not require invasive procedures and can give rapid results should be used in the diagnosis of CMV-GID. In this study, demographic information, immunosuppressive medications, patient complaints, laboratory parameters, endoscopic examination findings, antiviral treatment status, and follow-up results of 125 people diagnosed with CMV-GID and 177 people who were not diagnosed with CMV-GID based on histopathological examination of tissue samples, were retrospectively evaluated. Using “Receiver Operating Characteristic” (ROC) analysis, the cut-off value for plasma CMV viral load detected by PCR which can predict the diagnosis of CMV-GID was determined; the change of this threshold in different groups in terms of the underlying disorder was established; and a scoring system was developed to predict CMV-GID. The optimal cut-off value of plasma CMV viral load for the diagnosis of CMV-GID was found to be 272 copies/mL. Separate threshold values were also obtained for each underlying medical condition. In univariate analyses, being over the age of 65; use of systemic steroids; use of azathioprine; use of more than two immunosuppressive medications; presence of ulcer, exuding ulcer, irregular ulcer, large mucosal defect, macroscopic hemorrhage, and pancolitis in endoscopic examination were determined as risk factors and findings associated with CMV-GID. A scoring system has been proposed with the model using multivariate analysis. Accordingly, 8 points for being over 65 years of age; 5 points for using systemic steroids; 9 points for erosion, 11 points for ulcer, 6 points for pancolitis, 10 points for granular appearance in endoscopic examination; 7 points for an increase of greater than 1 log10 copies/mL in plasma CMV viral load between two consecutive samples. The optimal value of the total score for predicting CMV-GID was determined as 28.1. It has been shown that patients with a diagnosis of CMV-GID have longer hospital stays and higher mortality rates than those without, and improvement in clinical signs and symptoms was significantly common in patients with a diagnosis of CMV-GID who received antiviral treatment as compared to the group that did not receive treatment. The use of the proposed scoring system and determination of plasma CMV viral load can help predict CMV-GID and facilitate early diagnosis and treatment.tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherTıp Fakültesitr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectSitomegalovirüstr_TR
dc.subjectCMVtr_TR
dc.subjectSitomegalovirüs Gastrointestinal Hastalığıtr_TR
dc.subjectCMV-GİHtr_TR
dc.subjectPolimeraz Zincir Reaksiyonutr_TR
dc.subjectPCRtr_TR
dc.subjectEşik Değertr_TR
dc.subjectCut-Offtr_TR
dc.subjectReceiver Operating Characteristictr_TR
dc.subjectROCtr_TR
dc.subjectSkorlama Sistemitr_TR
dc.subject.lcshBulaşıcı hastalıklartr_TR
dc.titleSitomegalovirüs Gastrointestinal Hastalığının Tanısında Plazmada CMV Virüs Yükü Eşik Değeri Elde Edilmesi, Testin Tanısal Performans Ölçütlerinin Belirlenmesi ve Hastalığı Tahmin Etmeye Yönelik Skorlama Sistemi Geliştirilmesitr_TR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/othertr_TR
dc.description.ozetSitomegalovirüs (CMV), Herpesviridae ailesine ait bir DNA virüsüdür. Sağlıklı bireylerde primer CMV enfeksiyonu genellikle belirtisiz ya da çok hafif belirtilerle seyretmektedir. Primer enfeksiyonun ardından CMV doku ve organlarda latent olarak kalıp özel durumların varlığında reaktive olabilmekte, reenfeksiyon da gelişebilmektedir. Nakil alıcıları ve kazanılmış immün yetmezlik sendromunda olduğu gibi bağışıklık sisteminin kullanılan immünsupresif ilaç veya altta yatan hastalık nedeniyle baskılanmış olduğu durumlarda CMV’ye bağlı ağır seyir gözlenebilmekte, doku ve organ tutulumları hayatı tehdit edebilmektedir. CMV’ye bağlı organ tutulumu, sıklıkla akciğer, gastrointestinal sistem, göz, santral sinir sistemi ve karaciğerde görülebilmektedir. Sitomegalovirüs gastrointestinal hastalığı (CMV-GİH) ağızdan anüse kadar gastrointestinal sistem mukozasını döşeyen epitelde herhangi bir bölgeyi tutabilmektedir. Kanama ve perforasyon gibi hayatı tehdit edebilecek sonuçlara yol açabilmesi nedeniyle doğru ve erken tanısı oldukça önemlidir. CMV-GİH tanısında altın standart yöntem endoskopik biyopsi ya da cerrahi olarak çıkarılmış dokuda histopatolojik olarak CMV’ye atfedilen bulguların gösterilmesi ve mümkünse immünohistokimyasal inceleme ile tanının doğrulanmasıdır. Doku örneğinin elde edilmesi için invazif işlem gerekmesi, bazı hastalarda girişim yapılmasına engel teşkil edebilen durumların bulunması, hastanın girişimsel işleme onam vermemesi, histopatolojik incelemenin kısa sürede sonuçlanamaması nedeniyle tanı konulmasında güçlük veya gecikme yaşanabilmektedir. Doku tanısı olmaksızın CMV-GİH tanısını yüksek performans ölçütleriyle öngörmeyi sağlayabilecek ya da histopatolojik inceleme devam ederken preemptif tedavi kararını yönlendirebilecek invaziv olmayan ve erken sonuç veren yöntemlere ve yaklaşımlara gereksinim vardır. Girişimsel işlem gerektirmeyen ve hızlı sonuç verebilen bir yöntem olarak plazmada polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile CMV virüs yükünün saptanmasının CMV-GİH tanısında kullanılması üzerinde önemle durulmaktadır. Bu çalışmada, doku örneğinde histopatolojik inceleme sonucuyla CMV-GİH tanısı almış 125 kişinin ve CMV-GİH tanısı almamış 177 kişinin demografik bilgileri, immünsupresif tedavi alma durumları, hastalık yakınmaları, laboratuvar parametreleri, endoskopik muayene bulguları, antiviral tedavi alma durumları ve izlem sonuçları retrospektif olarak incelenmiştir. PCR ile saptanan plazma CMV virüs yükünün CMV-GİH tanısını öngörmeyi sağlayabileceği eşik değer (cut-off) “Receiver Operating Characteristic” (ROC) analizi ile belirlenmiş, bu eşik değerin altta yatan hastalık açısından farklı gruplarda gösterebileceği değişim ortaya konmuş ve CMV-GİH’i tahmin etmeye yönelik bir skorlama sistemi geliştirilmiştir. CMV-GİH tanısı koyabilmek için elde edilen plazma CMV virüs yükü optimal eşik değeri 272 kopya/mL olarak bulunmuştur. Altta yatan hastalıklara göre gruplar oluşturularak her hastalık için ayrı eşik değerler de elde edilmiştir. Hematopoetik kök hücre nakil alıcılarında yüksek duyarlılık ve özgüllükle 290 kopya/mL eşik değer olarak belirlenmiştir. Tek değişkenli analizlerde 65 yaşın üzerinde olmak, sistemik steroid kullanımı, azatioprin kullanımı, ikiden fazla immünsupresif ilaç kullanımı; endoskopik muayenede ülser, eksudalı ülser, düzensiz kenarlı ülser, geniş mukozal defekt, makroskopik kanama emaresi, pankolit görülmesi CMV-GİH lehine risk faktörleri ve bulgular olarak belirlenmiştir. Çok değişkenli analizler sonucunda oluşturulan model ile bir skorlama sistemi önerilmiştir. Buna göre 65 yaşın üzerinde olmak 8 puan; sistemik steroid kullanıyor olmak 5 puan; endoskopide erozyon görülmesi 9 puan, ülser görülmesi 11 puan, pankolit görünümü 6 puan, granüler görünüm olması 10 puan; ardışık alınan iki örnekte plazma CMV virüs yükünde log10 kopya/mL cinsinden bir birimden fazla artış olması 7 puan kazandırmaktadır. CMV-GİH tanısı koyabilmek için gereken skorun optimal değeri 28,1 olarak belirlenmiştir. CMV-GİH tanısı olanların, olmayanlara göre hastanede daha uzun süre kaldıkları ve ölüm oranlarının daha yüksek olduğu gösterilmiştir. Antiviral tedavi alan CMV-GİH tanılı hastalarda tedavi almayan gruba kıyasla, klinik belirti ve bulgularda düzelmenin anlamlı biçimde daha sık olduğu gözlenmiştir. Önerilen skorlama sisteminin ve plazma CMV virüs yükü tayininin birlikte kullanılmasının, CMV-GİH tanısının tahmin edilmesine ve erken tanı ile erken tedavinin sağlanmasına katkıda bulunabileceği kanaatine varılmıştır.tr_TR
dc.contributor.departmentİç Hastalıklarıtr_TR
dc.embargo.termsAcik erisimtr_TR
dc.embargo.lift2022-03-21T06:27:00Z
dc.fundingYoktr_TR
dc.subtypemedicineThesistr_TR


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster